在新疆维吾尔自治区文科类招生时，新疆农业职业技术学院有畜牧兽医、园艺技术、农产品加工与质量检测、种子生产与经营、园林工程技术等专业。在新疆维吾尔自治区理科类招生时，新疆农业职业技术学院有畜牧兽医、农产品加工与质量检测、种子生产与经营、园艺技术、食品检验检测技术等专业。

根据新疆2023年文科招生计划可知，新疆农业职业技术学院有以下44个专业：

1. 畜牧兽医

2. 园艺技术

3. 农产品加工与质量检测

4. 种子生产与经营

5. 园林工程技术

6. 食品检验检测技术

7. 现代物流管理(农产品方向)

8. 宠物养护与驯导

9. 风景园林设计

10. 水利工程

11. 食品智能加工技术

12. 药品质量与安全

13. 植物保护与检疫技术(航空植保方向)

14. 信息安全技术应用

15. 人工智能技术应用

16. 大数据与会计

17. 电子商务

18. 休闲农业经营与管理

19. 动物防疫与检疫

20. 工程造价

21. 机电一体化技术

22. 电气自动化技术

23. 物联网应用技术

24. 大数据技术

25. 商务管理(中亚贸易方向)

26. 市场营销

27. 酒店管理与数字化运营

28. 商务英语

29. 动物医学

30. 畜牧兽医(现代马产业技术)

31. 环境监测技术

32. 环境工程技术

33. 药品生产技术

34. 关务与外贸服务

35. 水产养殖技术

36. 建筑工程技术

37. 计算机网络技术

38. 现代农业装备应用技术

39. 畜禽智能化养殖

40. 国际商务

41. 智慧健康养老服务与管理

42. 棉花加工与经营管理

43. 数字媒体技术

44. 民政服务与管理

根据新疆2023年理科招生计划可知，新疆农业职业技术学院有以下45个专业：

1. 畜牧兽医

2. 农产品加工与质量检测

3. 种子生产与经营

4. 园艺技术

5. 食品检验检测技术

6. 软件技术

7. 园林工程技术

8. 现代物流管理(农产品方向)

9. 植物保护与检疫技术(航空植保方向)

10. 风景园林设计

11. 水利工程

12. 食品智能加工技术

13. 药品质量与安全

14. 大数据与会计

15. 电子商务

16. 宠物养护与驯导

17. 信息安全技术应用

18. 人工智能技术应用

19. 市场营销

20. 畜牧兽医(现代马产业技术)

21. 物联网应用技术

22. 大数据技术

23. 酒店管理与数字化运营

24. 休闲农业经营与管理

25. 动物医学

26. 动物防疫与检疫

27. 环境监测技术

28. 工程造价

29. 机电一体化技术

30. 电气自动化技术

31. 药品生产技术

32. 关务与外贸服务

33. 商务管理(中亚贸易方向)

34. 商务英语

35. 环境工程技术

36. 现代农业装备应用技术

37. 计算机网络技术

38. 水产养殖技术

39. 建筑工程技术

40. 国际商务

41. 智慧健康养老服务与管理

42. 棉花加工与经营管理

43. 畜禽智能化养殖

44. 数字媒体技术

45. 民政服务与管理