在山东省招生时，济宁医学院有口腔医学、医学影像学、临床医学、儿科学、中西医临床医学等专业。

根据山东2023年招生计划可知，济宁医学院有以下38个专业：

1. 口腔医学

2. 医学影像学

3. 临床医学

4. 儿科学

5. 中西医临床医学

6. 法医学

7. 精神医学

8. 预防医学

9. 针灸推拿学

10. 医学检验技术

11. 临床药学

12. 卫生检验与检疫

13. 中药学

14. 康复治疗学

15. 药学

16. 助产学

17. 应用心理学

18. 护理学

19. 制药工程

20. 生物制药

21. 英语

22. 药物制剂

23. 生物医学工程

24. 生物技术

25. 护理学(校企合作，与水发民生产业投资集团有限公司)

26. 计算机科学与技术

27. 生物工程

28. 康复工程

29. 生物信息学

30. 医学信息工程

31. 公共事业管理

32. 公共事业管理(校企合作，与达内时代科技集团有限公司合作)

33. 英语(校企合作，与青岛英谷教育科技股份有限公司合作)

34. 信息管理与信息系统

35. 市场营销

36. 市场营销(校企合作，与山东开创集团股份有限公司合作)

37. 计算机科学与技术(校企合作，与青岛英谷教育科技股份有限公司)

38. 计算机科学与技术(校企合作，与淄博开创云计算有限公司合作)