南京大学拥有一支高素质的师资队伍，其中包括中国科学院院士30人，中国工程院院士4人，国家级领军人才327人次，国家级青年人才347人次，国家科技重大专项、"973计划"、"863计划"、国家重点研发计划等重大项目首席科学家103人次，国务院学位委员会学科评议组成员22人，国家级教学名师11人，"百千万人才工程"国家级人选38人。
| 编号 | 实验室名称 |
| 1 | 海岸与海岛开发教育部重点实验室 |
| 2 | 中尺度灾害性天气教育部重点实验室教育部重点实验室 |
| 3 | 介观化学教育部重点实验室 |
| 4 | 现代天文与天体物理教育部重点实验室 |
| 5 | 模式动物与疾病研究教育部重点实验室 |
| 6 | 表生地球化学教育部重点实验室 |
