| 序号 | 学科名称 |
| 1 | 药理学与毒物学 |
| 2 | 临床医学 |
权威性：ESI由世界著名学术信息出版机构ISI(美国)推出，已成当今世界范围内高校国际学术水平及影响力的重要评价指标工具之一。
| 院系 | 招生专业 |
| 中西医结合学院（生命科学学院） | 中西医结合基础，中医药信息学，微生物与生化药学，药理学 |
| 药学院 | (专业学位)中药学，(专业学位)药学，药物化学，药剂学，生药学，药物分析学，微生物与生化药学，药理学，药物代谢动力学，中药学 |
| 医药信息工程学院（网络信息中心） | 中医药信息学 |
| 医药经济管理学院 | 社会医学与卫生事业管理 |
| 护理学院 | (专业学位)护理 |
| 马克思主义学院 | 马克思主义理论 |
| 第一临床医学院（第一附属医院、安徽省中医院） | (专业学位)中医内科学，(专业学位)中医外科学，(专业学位)中医骨伤科学，(专业学位)中医妇科学，(专业学位)中医儿科学，(专业学位)中医五官科学，(专业学位)针灸推拿学，(专业学位)中西医结合临床，(专业学位)全科医学(中医，不授博士学位)，中西医结合临床 |
| 第二临床医学院（第二附属医院、安徽省针灸医院） | (专业学位)中医内科学，(专业学位)中医骨伤科学，(专业学位)针灸推拿学 |
| 第三临床医学院（第三附属医院、安徽省中西医结合医院、神经病学研究所） | (专业学位)中西医结合临床，中西医结合临床 |
| 中国科学院上海药物研究所 | (专业学位)中药学，(专业学位)药学 |
| 安医大一附院高新院区 | 中西医结合临床 |
| 合肥综合性国家科学中心大健康研究院新安医学与中医药现代化研究所 | (专业学位)中药学，中西医结合 |
