生物制药专业人才培养目标是：培养德智体全面发展，具有良好职业素质，系统掌握生物工程制药的基本理论、基本知识、基本技能，能在生物药物研制与开发单位、生物药物生产和流通企业、医药院校、药检所、药政管理等部门从事药物研究与开发、生产、检验、质量控制等工作的应用型生物工程制药专门人才。

医药行业是按国际标准划分的15类国际化产业之一，被称为“永不衰落的朝阳产业”，其中作为新兴产业的生物制药业更是被称为“朝阳产业中的朝阳产业”。从20世纪80年代以来，世界医药市场每年以8-10%的速度增长，中国药品市场以20%左右的速度增长。我国已将生物制药作为经济发展的重点建设行业和高新技术的支柱产业来发展。随着国家政策的大力支持，生物制药行业蕴藏着巨大的市场机遇，对于既具备生物技术专业背景知识又具备制药工程、药物制剂、药物分析专业知识的复合型专业技术人员的需求缺口较大，因此生物制药专业人才的就业前景非常美好。

生物制药专业毕业生可以在有关制药企业、科研单位、高等院校及医药公司等部门从事生物药物的研究与开发、生产、经营和管理、药物检验、医药工程设计以及外贸、医药代表、营销等工作，还可以考取执业药师职业资格证书。毕业生也可以在生命科学、药学相关领域继续学习，在国内外科研院所攻读硕士、博士学位，成为生物医药领域的顶尖人才。