| 年份 | 软科中国最好大学排名 |
| 2025 | 500 |
| 2024 | 600 |
| 2023 | 600 |
| 年份 | 软科医药类排名 |
| 2025 | 56 |
| 2024 | 77 |
| 2023 | 77 |
| 年份 | 武书连中国大学综合实力排名 |
| 2025 | 801 |
| 2024 | 807 |
| 年份 | 校友会中国大学排名 |
| 2025 | 517 |
| 2024 | 531 |
| 2023 | 528 |
| 年份 | 校友会医药类排名 |
| 2025 | 86 |
| 2024 | 82 |
| 2023 | 82 |
| 年份 | 金平果本科院校竞争力排名 |
| 2025 | 988 |
小结： 新疆第二医学院2025年排名全国第500~988位，新疆第二医学院在全国的认可度比较高。
