学校执行教育部规定的“学校负责，招办监督”的录取体制，在教育部领导下，由各省级招办统一组织录取。
学校按照理工类、文史类、艺术类分类录取考生，浙江省、上海市、北京市、天津市、山东省、海南省、河北省、辽宁省、江苏省、福建省、湖北省、湖南省、广东省、重庆市按专业（专业组）设定的选考科目要求录取考生。
调档比例按照各省级招办有关要求及我校生源情况确定。对实行平行志愿的批次，投档到我校且服从调剂的考生不退档。对实行梯度志愿的批次，且投档数大于计划数，学校按总分（含政策加分）排序后，按计划数确定分专业名单，再按实际高考成绩（不含政策加分）分专业。
专业录取时不设专业志愿分数级差，以分数优先为原则，即按高分到低分排序，按照考生填报的专业志愿顺序依次录取。所报专业志愿都无法满足的考生，如服从专业志愿调剂，将调剂到招生计划未满专业；按专业组填报志愿的上述考生，在本专业组内招生计划未满专业进行调剂；如不服从专业志愿调剂，作退档处理。在内蒙古自治区实行“招生计划1:1范围内按专业志愿排队录取”的录取原则，专业分配承认政策加分。
学校认可教育部和各省（区、市）教育主管部门审定的全国性照顾政策，认可黑龙江省招生委员会制定的省属院校照顾政策，但照顾政策分值不得超过20分；除内蒙古自治区外专业分配以考生的实际高考成绩（不含政策加分）作为录取依据。
学校确定进档考生专业分配按分数优先的原则，若考生高考总分相同，理工类专业按照数学、综合、语文、外语的顺序排序，文史类专业按照语文、综合、数学、外语的顺序排序。高考综合改革省份进档考生若高考总分相同，按照各省份投档位次的顺序排序。
视觉传达设计、环境设计、广播电视编导专业录取规则：学校在省级招办投放的考生电子档案范围内，按照文化课成绩从高到低录取；如文化课成绩相同，按专业课成绩择优录取；如专业课成绩仍相同，按照语文、外语、数学单科成绩排序规则择优录取。音乐表演专业录取规则：学校在省级招办投放的考生电子档案范围内，按照专业课成绩从高到低录取（器乐按小项分别排序录取）；如专业课成绩相同，按文化课成绩择优录取；如文化课成绩仍相同，按照语文、外语、数学单科成绩排序规则择优录取。
农学（本硕博班）、园艺（本硕博班）、农业资源与环境（本硕博班）、动物科学（本硕博班）、动物医学（本硕博班）、农业机械化及其自动化（本硕博班）、农林经济管理（本硕博班）、生物科学（本硕博班）、食品科学与工程（本硕博班）、计算机类（包括计算机科学与技术、物联网工程、软件工程、人工智能）、生物科学类（包括生物科学、生物技术、生物工程）、制药工程、数据科学与大数据技术、汉语国际教育等专业公共外语课采用英语授课，非英语语种考生慎重报考。
动物医学、金融学（中俄合作办学）、工商管理（中俄合作办学）、国际经济与贸易（中俄合作办学）专业学制五年，其他专业（类）学制四年。
我校中俄合作办学项目包括国际经济与贸易、金融学、工商管理3个专业，其中国际经济与贸易是我校与俄罗斯太平洋国立大学合作办学的项目，金融学、工商管理是与俄罗斯远东国立技术水产大学合作办学的项目。根据俄方签证要求，只有获得普通高级中学毕业证书的学生方可报考，中等职业教育、成人高中、同等学力的毕业生不能报考。录取到中俄合作办学专业的学生报到时须携带高中毕业证、学业水平考试（会考）合格证和有效护照，并且入学后第2-4学期必须出国学习，不能转专业。学生完成学业后，达到我校学籍管理规定要求，将获得东北农业大学的毕业证书和学士学位证书。
中俄合作办学项目国内学习期间学费15750元／年，国外学习期间，因近期卢布汇率波动较大，太平洋国立大学学费待定，（2021年为185930卢布），远东国立技术水产大学每年学费和宿费2700美元。（俄方学校根据物价、汇率的变化可能适当上浮收取）
我校园艺（中新实验班）是与新西兰梅西大学联合培养项目。此项目只招收具有出国留学意愿并能承担办理出国手续及在新期间费用的考生。根据新方签证要求，获得普通高级中学毕业证书、学业水平考试（会考）合格证的学生方可报考，高考英语成绩要求不低于105分。录取到园艺（中新实验班）的学生不能转专业。学生完成园艺（中新实验班）4年人才培养方案中规定的全部课程，达到我校毕业要求和学位授予条件，将获得东北农业大学毕业证书和学士学位证书。学生第4年在梅西大学学习期间，如满足攻读条件，可选择攻读梅西大学硕士学位，可提前修读研究生课程，第5年在梅西大学继续硕士研究生学习，达到梅西大学硕士学位授予条件，可获得梅西大学硕士学位证书。
园艺（中新实验班）项目国内学习期间学费3000元／年，第4年国外学习期间梅西大学学费、食宿费等费用大约36000新西兰元，如选择攻读梅西大学硕士学位，第5年国外学习期间梅西大学学费、食宿费等费用大约60000新西兰元。
录取体检标准按照教育部、卫生部、中国残疾人联合会印发的《普通高等学校招生体检工作指导意见》及有关补充规定执行。
